用ACD/ChemSketch Version绘制化学结构式

杨思尧
1998年 第13期 15版

#1　　在《电脑报》上曾介绍过绘制化学分子式的工具软件Chem Windows 3.0（化学之窗），引起很多读者兴趣，可惜的是，大多数人无法找到这个软件。在今年1月推出的《电脑报配套光盘第四辑》中，我们特别推荐了一个ACD／ChemSketch V1.0，试试这个软件，亦有异曲同工之妙。
　　ChemSketch是加拿大Advanced Chemistry Development公司的产品，是一个优秀的共享软件。该软件在绘制化学结构式时显示出极其强大的功能，而且越是复杂，越显威力。
　　从前我们使用一般的排版软件，在排版过程中，遇有复杂的化学结构式时，由于不是很直观，往往很难处理，某些排版非常费力，甚至有些根本无法完成。即使拼拼凑凑排出，又往往不很规范。而使用ACD的ChemSketch则让我们事半功倍。
　　下面就将该软件的一些主要功能及用法介绍如下。
　　该软件需要安装在Windows 3.1/95下，仅占用大约1.8M的硬盘空间。
　　运行该软件时计算机屏幕上出现如^131501a^的主界面。
　　位于主界面顶端的一排快捷键的功能（下拉式菜单中的功能均可从快捷键中找到）依次为：
　　1.操作工具：包括“Undo”和“Redo”。可以恢复前一步的操作或重复上一步操作。
　　2.键型工具：包括：（1）“Draw Normal”：可以在主画面中分别画出选中的多个结构，而其间并无键连接；（2）“Draw Continuous”：功能与前者相似，只是在每画完两个结构后就将其用化学键连接；（3）“Up Stereo Bonds”：可以绘制立体构象中在前面的化学键；（4）“Down Stereo Bonds”：绘制立体构象中在后面的化学键；（5）“Coordinating Bonds”：可以绘制配位键。
　　如果欲绘制双键或叁键，可将光标移至已绘好的单键上，此时单键会出现三点被选取的标记，单击中间点，即可改变键的数量。
　　3.选取工具：可选择“Select by Lasso/Rectangle”：可以选择欲操作的元素构成部分。该工具可以在“索套”和“矩形”两者之间转换。
　　4.编辑工具：包括：（1）“Move Normal”：移动元素构成部分。移动过程中如两组成部分之间有化学键相连，键仍保持连接状态；（2）“Move，Rotate，Resize”：此为移动键角和键长的设定工具；（3）“Erasse”：擦除工具。
　　5.方向工具：包括：（1）“Set Bond Horizontally”：可将绘制出来的结构式中被选取的键置为水平状态；（2）“Set Bond Vertically”：可将绘制出来的结构式中被选取的键置为垂直状态；（3）“Flip on Bond”：可以将绘制好的结构式以选取键为轴进行翻转。
　　6.镜像工具：将整个版面做镜像处理。包括：“Flip Top to Bottom”（垂直镜像）和“Flip Left to Right”（水平镜像）。
　　7. 屏幕工具：可以设定版面中绘制好的结构式的尺寸。包括：“Size More”（放大）、“Size Less”（缩小）和“Fit Screen”（适应屏幕）。
　　8. 结构工具：包括：（1）“Clean Structure”：可以用标准的键长和键角来画出化学结构式。即画好一个结构式后，选此按键可以将该结构式中的每个键的长度和键角以最合理的分布方式绘出；（2）“Copy Structure to Sketch Window”：可以将已经绘制好的化学结构式通过剪贴板拷贝到草稿窗口中。
　　位于主界面左侧的快捷键功能依次为：
　　1.元素周期表（Periodic Table of Elements）：选取此项时屏幕会弹出如^131501b^的窗口。可用光标确定所需元素，当光标移至某一元素时，在该窗口中的信息提示板上将会看到选中元素的名称（符号及英文名称，原子序号）、原子量（Mass）、密度（Density）、氧化态（Oxidation States）、电子构型（Electro Configuration）。被选取的元素将会显示在该列快捷键的最下方，供以后重复选用，共可存放4个元素符号，这些元素使用时如果是金属或金属性强的，都是以最常见的离子形式给出；如果为非金属元素，则以其氢化物给出；如果是惰性元素，则以其原子形式显示。
　　2.常用元素符号：由于化学结构式多在有机化学中出现，因此常用元素中只列了C、H、N、O、P、S、Cl、Br八种。它们是以其与氢的化合物的形式画入主画面中的。
　　3.设定工具（Set Atoms Properties）：选择此功能后，再用鼠标单击主画面中的分子式，可以分别设定所选中元素的各个参数。包括：所带电荷数（Charge）、同位素情况（Isotope）、化合价（Valence）、所选择元素单元的总数量（Numbering），设定完成后各参数的数值分别显示在元素的相应位置上。
　　4.增加正电荷（Increment （＋） Charge）：可以增加所选元素所带正电荷的数量。
　　5.增加负电荷（Decrement （－） Charge）：可以增加所选元素所带负电荷的数量。
　　位于主界面右侧的快捷键功能依次为：
　　1.环模板（Rings Templates）：可以选择使用一些现存的常用环状结构的化合物，如三元环、四元环及某些环状结构的立体构象。
　　2.链模板（Chains Templates）：可以选择使用某些常用的链状结构的有机化合物。
　　3.基团模板（Groups Templates）：有许多现存的基团（简单的有机化合物）可供选择使用。
　　4.用户自定义模板（User和User 1）：用户可以将已经绘制完成的且经常使用的化学结构式，使用主界面顶端的下拉式菜单中的“模板”（Templates）中的“Save User Templates”功能将其保存为用户模板，以备以后使用。
　　5.基团表（Radical Tables）：可以从中选择使用一些常见的基团，供直接或修改使用。每当光标移至一个基团上时，信息显示窗口中都会显示其英文名称。如^131501c^所示。
　　在这个窗口中分7个区，分别是“Chains”（链状结构）、“Cycles”（环状结构）、“C－Groups”（含有碳元素的基团）、“Miscellaneous”（除含碳元素外还包含有其它元素的化合物，如N、S、P等元素）、“Amino Acids”（氨基酸）、“Nucleotides”（核苷酸）和“Protecting Groups”（保护基团），每个区中有许多现存的结构供选择使用。
　　此快捷工具的最下方可以保留最近使用过的9个基团的快捷键，以方便重复使用。
　　绘制完成的化学结构式的分子量可以在主界面下方的“Mol.W.”窗口中显示。
　　制作完成的化学结构式，可以通过“Molecule”和“Sketch”在绘制化学结构式窗口和草稿窗口进行相互切换。在“Sketch”窗口中可以排入文字等。
　　应用该软件绘制出来的化学结构式，可以用mst格式（ChemSketch专用文件格式）保存于文件中，虽然该格式无法为其它基于Windows的软件所调用，但使用贴图方法，对使用小胶印机印刷来说已经完全可以满足要求。
　　该软件绘制的化学结构式可以达到专业水平，尤其适合高校在排印化学教材时使用。
　　《电脑报配套光盘第四辑》上有该软件的1.0版本，在http://www.sxst.it/上能找到该软件2.5版的最新资料。


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